Spišské múzeum v Levoči je ďalším špecializovaným múzeom Slovenského národného múzea s celoštátnou pôsobnosťou. V rámci múzejnej špecializácie sa zameriava na výskum historického vývoja mesta Levoča, umeleckohistorický výskum v regióne pôsobenia múzea, výskum Majstra Pavla z Levoče v domácom a stredoeurópskom kontexte, vývoj Spišského hradu a jeho okolia, zapísaného v Zozname svetového kultúrneho dedičstva UNESCO. Rôznorodý zbierkový fond múzea sa prezentuje v niekoľkých expozíciách, pričom veľmi atraktívnymi a návštevníkmi najviac navštevovanými sú Spišský hrad a expozícia Majstra Pavla z Levoče, tvorcu najvyššieho gotického oltára na svete, ktorý zdobí kostol sv. Jakuba v Levoči. Múzeum sídli v renesančnom meštianskom dome na námestí Majstra Pavla v Levoči č. 40.